Oxford Nanopore多款产品升级，多重低通量测序仪Plongle预计明年发布
2012年2月，来自英国的Oxford Nanopore Technology（以下简称Oxford Nanopore）公司发布了世界上首款便携式基因测序仪MinION。2014年4月，第一批MinION正式登上历史舞台。2015年5月，MinION正式商业化。从最初的饱受争议，到后来的广受好评，Oxford Nanopore凭借纳米孔测序技术已成为基因测序领域的新秀。随着各界对纳米孔测序产品关注度的提高，Oxford Nanopore此后相继发布了台式测序仪GridION、高通量测序仪产品PromethION以及袖珍型、可用于单次检测的Flongle流动槽适配器。
近日，测序中国获悉，Oxford Nanopore计划对其现有平台和产品套件进行多次升级和更新，以提高测序通量和准确性，同时降低成本。Oxford Nanopore首席技术官Clive Brown在近日举办的年度用户会议上介绍，公司正在开发一种可实现96孔板多重低通量测序的Plongle测序仪，以及一种新型DNA数据存储技术。此外，他还分享了公司其他业务产品的研发和升级进展。
PromethION 48
今年1月，Oxford Nanopore表示，新推出的PromethION 24和PromethION 48测序平台已经可供用户订购。P48测序仪是目前产能最高的三代测序仪，其在最佳内部运行中能够生成7.6 Tb数据，客户端最佳运行中可产生超过5 Tb数据。与之相比，P24的最佳内部运行可产生3.8 Tb数据。Brown表示，P48测序仪仍有进一步改进的空间，使其能够在一次运行中生成20 Tb的数据。
GridIon X5测序仪
除了新的测序平台，Oxford Nanopore也致力于对Gridion X5测序仪的更新，该产品预计于今年9月开始销售。GridIon X5是一款桌面式纳米孔测序仪，通量介于MinIon和PromethIon平台之间。该测序仪可带动5个MinION流动槽，这些流动槽可单独使用或协同使用，并可在单台设备中完成数据处理。
据Brown介绍，升级版的Gridion X5将拥有一个不同的GPU，允许其以更小的电量运行，解决该测序仪耗电量方面的技术问题，使产品更加可靠。GridIon升级服务将免费提供给现有GridIon客户。
Flongle流动槽适配器
今年3月，Oxford Nanopore推出了配备一次性流动槽的MinIon和GridIon系统。Brown介绍，Flongle是用于MinIon或GridIon的流动槽适配器，具有巨大的发展前景，但大量生产Flongle也是一项巨大的挑战。为此，Oxford Nanopore正努力扩大Flongle的生产制造，并为其建造了一座新工厂。他表示，目前，Fongle客户运行每轮输出数据量为1.9GB，超过了公司内部记录的1.5GB。此外，客户中位数据产出为524 Mb/run。因此，Flongle的数据产量仍有增加1~4倍的空间。
Flongle体积小巧，用户能够在任何地点开展测序分析，包括实验室、农场、医疗机构或户外环境等。但在价格方面，有用户认为一个适配器和48个流动槽的套餐价格（5250美元）过于昂贵。为解决这一问题，Brown在会上表示，Oxford Nanopore已经将最便宜的Flongle套餐价格降至1,860美元，其中包含一个适配器和12个流动槽，并允许用户以750美元的价格购买额外的适配器，以90美元购买额外的流动槽。
据Brown介绍，Oxford Nanopore将生产一种新型R10流动槽，其中包含一种新型纳米孔，具有更长的通道和双读取接头。新型R10流动槽可提供更准确的检测数据，并且很快就能广泛提供给客户。该流动槽将于6月开始为MinIon和GridIon客户提供，PromethIon为7月，Flongle为9月。之前的R9.4.1流动槽仍可在所有Oxford Nanopore设备上使用，R9.5.1流动槽仅供Minion和Gridion使用。
DNA测序技术的发展将数据存储带入了一个革命性时代，Oxford Nanopore也在探索DNA数据存储领域。会上，Brown公布了Oxford Nanopore的新型DNA数据存储技术。该技术将利用蛋白纳米孔在DNA上“书写”，就像录制磁带一样，以DNA修饰的形式对序列信息进行编码。例如，修改后的胞嘧啶可编码“1”，未修改的胞嘧啶编码为“0”。DNA修饰将发生在纳米粒内部，可被化学试剂或光触发。纳米孔也可以作为内置的校对装置，并用于解读或读取存储的信息。
Brown表示，虽然信息密度将减少10倍左右，但这种新的信息存储方式比传统的DNA合成技术更具可扩展性。“我们还不确定该技术是否具有商业可行性，但如果能够让其良好运作，我认为这是有可能实现的。”
MinIon Mk1C
除了以上产品，Brown还介绍了几款产品的最新动态。他表示，集合MinIon测序和实时数据分析于一身的便携式设备MinIon Mk1C将于今年7月开始提供。此外，Oxford Nanopore已经开发了一款新的专用集成电路（ASIC），其耗电少，占地面积小，通道多达400个。由于成本较低，ASIC将被设计成一次性使用的产品。
新的专用集成电路（ASIC）
虽然新的ASIC可能成为计划中手机测序仪SmidgION的一部分，但Oxford Nanopore计划将其首先用于Plongle多重测序平台，该平台将使用Flongle设备。Plongle能够使用96孔板进行纳米孔测序，每个板上都配有一个新的ASIC和70个通道。据Brown介绍，Plongle的预定发布日期是2020年下半年。该平台的预期初始测序数据产量为每孔0.5~1 Gb，每孔价格为25~50美元。
Plongle多重测序平台
值得关注的是，Oxford Nanopore还在研究一年前推出的基于Voltrax的液滴测序技术。该技术将能够实现微量DNA的测序，包括单细胞测序。这项技术将结合VolTrax样本制备平台的元件和MinION测序仪技术，最终开发出一款目前还未命名的新仪器。Brown表示：“我们仍然在努力，该研究正在顺利进行。尽管仍有许多设计工作需要完成，但我们已经完成了测序化学原理和技术的概念证明。该技术可能在明年（2020年）以某种形式呈现。”
参考资料：
1.Oxford Nanopore Previews Upcoming Products, Outlines Nanopore-Based DNA Data Storage Tech
2.https://nanoporetech.com/products
· END ·
活动推荐
热文推荐
GRAIL多癌种早期检测产品获美国FDA突破性设备认证
嘉因生物获千万人民币Pre-A轮融资
NEB全球首推高效替代重亚硫酸盐转化的酶学转化法！
喜欢别忘了点“在看”哟↘️